影片讲述了寄养在寺庙的童子僧东东意外发现了一伙盗贼的阴谋，并在小姑娘明明的帮助下，利用熟悉寺院环境以及平时整蛊师兄们的小技术，设计种种关卡，让盗贼吃尽苦头的故事。和美国电影《小鬼当家》系列相比，《小和尚大当家》同样是恶整盗贼的故事，东东整蛊盗贼的竹枪、鞭炮、珠子、佛珠、弹弓等道具，都是极具中国特色的元素。
